进入21世纪以后，太湖流域水资源、水环境问题更加突出，这一阶段的太湖治理就逐步从防洪保安向水环境治理、水安全保障、水资源配置并重转变，称为“二轮治太”。“二轮治太”共有12项重大水利工程，其中浙江涉及5项， 4项与湖州有关，太嘉河工程、苕溪清水入湖河道整治工程、杭嘉湖地区环湖河道整治工程、扩大杭嘉湖南排工程组成了湖州“二轮治太”四大重点水利工程。这四大重点水利工程总投资约115亿元，是湖州有史以来投资规模最大的水利项目，开启了湖州水利大建设、大发展的新篇章。
    　2011年，太嘉河工程试验段率先开工建设。 2012年和2013年，苕溪清水入湖河道整治工程险工段、应急段也相继开工建设。这些试点工程为四大重点水利工程全面建设积累了丰富经验。
　　2014年8月20日，省委、省政府在湖举行省重点建设项目“集中开工月”活动启动暨太湖治理太嘉河工程开工仪式，吹响了四大重点水利工程全面建设的号角。 2015年4月15日，我市举行苕溪清水入湖河道整治工程开工仪式，苕溪清水入湖河道整治工程总投资64.75亿元，是湖州有史以来投资规模最大的单个项目，刷新了历史纪录。
　　工程启动以来，正逢中央提出加快172项节水供水重大水利工程“扩投资、稳增长、调结构、防风险、惠民生”重大决策部署，也正逢浙江省委作出“五水共治”重大决策部署，全市上下以“水利工程、政治任务”的认识和担当，提速推进重点水利工程。太嘉河、杭嘉湖地区环湖河道两项工程在2016年底就基本建成，实现了“三年工期两年干”。苕溪清水入湖河道整治、扩大杭嘉湖南排工程于2018年全面建成，实现了“四年工期三年干”。
　　太嘉河工程

　　该工程全部位于湖州市境内，北接太湖，南连京杭运河，主要对汤溇港、幻溇港两条河道进行整治，整治河道总长度约53.75公里，涉及德清县、吴兴区、南浔区共9个乡镇49个行政村。
　　苕溪清水入湖河道整治工程
　　该工程位于湖州市和杭州市境内，其中湖州市境内工程分别由西苕溪整治工程、东苕溪整治工程、长兴港整治工程和杨家浦港整治工程等子项目组成，整治河道总长度约198.8公里，涉及全市各县区的24个乡镇138个行政村。
　　杭嘉湖地区环湖河道整治工程
　　该工程全部位于湖州市境内，北接太湖，南连双林塘，主要对罗溇港、濮溇港进行整治，整治河道总长度约39.01公里，涉及吴兴、南浔区7个乡镇32个行政村。
　　扩大杭嘉湖南排工程
    　该工程涉及湖州、杭州和嘉兴三市，湖州市主要是德清县境内长山河延伸拓浚工程（德清段）、盐官下河延伸拓浚两大工程，整治河道总长度约46.4公里，涉及湖州市德清县6个乡镇27个行政村。
　　“二轮治太”四大重点水利工程建成后，发挥了防洪排涝、水环境治理、水资源配置等多方面的综合效益，为整个杭嘉湖地区带来巨大民生福祉。
    　行洪通道全面畅通，重要河段防洪标准提升到50年一遇以上。打通北排入湖、南排钱塘江和杭州湾的通道，完善杭嘉湖地区的防洪工程体系。同时，进一步提高西苕溪两岸、东苕溪西岸以及入太湖四大溇港等骨干河道的防洪标准，重要河段防洪标准提升到50年一遇以上，部分河段防洪标准提升到100年一遇，构筑起“太湖安全、苕溪安全、南排安全”三大防线，保障区域防洪安全。在2016年太湖连续超保证水位25天，逼近1999年历史最高洪水位的情况下，湖州汛情依然平稳，很大程度上得益于多年来的水利建设。
    　水环境状况切实改善，入太湖水质稳定保持在Ⅲ类及以上，减轻了四大工程所含10条河道的内源污染，减少入太湖污染物总量，增强太湖的湖体环流，提升水体自净能力，改善太湖和杭嘉湖平原的水生态环境。
    　水资源配置明显优化，畅通了杭嘉湖平原与太湖之间调水引排的动脉，提高引水能力，解决干旱季节杭嘉湖平原水量不足的问题。
    　四大工程建设进度一直都走在前列，因为进度快，获得省政府奖励资金1.3亿元，并助推全市水利工作连续四年获得省水利厅考核优秀，助推全市连续四年夺得“五水共治”优秀市“大禹鼎”，成功创建全国首批水生态文明试点城市。（湖州日报）